Ecología molecular de ambientes extremos
Resumen de Investigación:
Esta área tiene los siguientes objetivos:
Acidófilos: ecología microbiana convencional, ecología molecular, biología molecular y biotecnología de ambientes ácidos extremos (biominería, secuestro específico de metales, bio-mineralización y fito-remediación). Este objetivo está fundamentalmente interesado en la exploración de posibles aplicaciones biotecnológicas de los microorganismos acidófilos, la mayoría relacionados con la recuperación de metales a partir de minerales y de aguas contaminadas.
Geomicrobiología del subsuelo de la Faja Pirítica Ibérica (IPB): caracterización del bio-reactor subterráneo responsable de las condiciones extremas detectadas en la cuenca del Río Tinto. El desarrollo de este objetivo comporta la identificación de los microorganismos involucrados en los ciclos biogeoquímicos (C, N, S y Fe) operativos en el subsuelo de la IBP. Los microorganismos reductores de nitrato han sido identificados como responsables de la oxidación del ión ferroso en condiciones anaerobias estrictas, facilitando el ataque químico a la gran concentración de sulfuros metálicos existentes en la IPB, generando las condiciones extremas detectadas en la cuenca del Tinto.
Caracterización geomicrobiológica de ambientes extremos como modelos de habitabilidad de interés astrobiológico: Los siguientes ecosistemas están siendo estudiados en nuestro grupo: Río Tinto, España (análogo de Marte); lago salado de Uyuni, Bolivia (análogo de Europa); lago hipersalino de Tirez, España (análogo de Europa) y Dallol en la depresión del Danakil, Etiopía (análogo de Marte). Este objetivo persigue la caracterización de distintos ambientes extremos como modelos de vida en distintos planetas y lunas del sistema solar. Esta investigación está interesada en conocer los límites de la vida y caracterizar ecosistemas análogos terrestres con el fin de preparar futuras misiones de exploración espacial.
Obtención de muestras del subsuelo en condiciones anaerobias.
CARD-FISH en una muestra de -284m de profundidad.
| Apellidos | Nombre | Laboratorio | Ext.* | Categoría profesional | |
|---|---|---|---|---|---|
| Abad Lorenzo | José Pascual | 104 | 4545 | jpabad(at)cbm.csic.es | Profesor Titular Universidad, GA |
| Amils Pibernat | Ricardo | 104 | 4504 | ramils(at)cbm.csic.es | Emérito |
| Bueno Alonso | Marina | 104 | 4678 | Estudiante TFG | |
| Carrasco Ropero | Ignacio | 104 | 4545 | icarrasco(at)cbm.csic.es | Contrato Predoctoral |
| Gómez Ruiz | Laura | 104 | 4678 | laura.gomez(at)cbm.csic.es | Titulado Sup.de Actividades Técn. y Profes. GP1 |
| Martínez Bonilla | Adrián | 104 | 4545 | amartinez(at)cbm.csic.es | Titulado Sup. Actividades Tecn. y Prof.GP1 |
| Martínez Lozano | José Manuel | 104 | 4545 | jmm.lozano(at)cbm.csic.es | Profesor Ayudante Doctor |
| Mateos Budiño | Guillermo | 104 | 4545 | gmateos(at)cbm.csic.es | Contrato Predoctoral |
| Ochoa Arizu | Inés | 104 | 4504 | Estudiante TFG | |
| Peinador Pedregal | Elena | 104 | 4678 | Estudiante TFM | |
| Ruano Gallego | David | 104 | 4678 | druano(at)cbm.csic.es | Investigador Doctor |
| Sabroso de la Torre | Esteban | 104 | 4545 | Estudiante TFM | |
| Velasco Dominguez | Esther | 104 | 4545 | evelasco(at)cbm.csic.es | Estudiante |
| Vidal Mas | Andrea | 104 | 4504 | Estudiante TFM |
Publicaciones relevantes:
- Gómez, F., Cavalazzi, B., Rodríguez, N., Amils, R., Ori, G.G., Olsson-Francis, K., Escudero, C., Mártínez, J.M., Mirtus, H. (2019) Ultra-small microorganisms in the polyextreme conditions of Dallol volcano, Northern Afar, Ethiopia. Scientific Reports 9: 7907 doi: 10.1038/s41598-019-44440-8.
- Ramos-Barbero, M.D., Martínez, J.M., Almansa, C., Rodríguez, N., Villamor, J., Gomariz, M., Escudero, C., Rubin, S., Antón, J., Martínez-García, M., Amils R. (2019) Prokaryotic and viral community structure in the singular chaotropic salt lake Salar de Uyuni. Environ. Microbiol. 21(6): 2029-2042, doi: 10.1111/1462-2920.14549.
- Tornos, F., Oggerin, M., de los Ríos, A., Rodríguez, N., Amils, R., Sanz, J.L., Rojas, P., Velasco, F, J.M. Escobar, Gómez, C., Slack, J.F. (2018) Do microbes control de formation of giant copper deposits? Geology, 47(2): 143-146, doi:10.1130/G45573.1.
- Puente-Sánchez, F., Arce-Rodríguez, A., Oggerin, M., Carcía-Villadangos, M., Moreno-Paz, M., Blanco, Y., Rodríguez, N., Bird, L., Lincoln, S.L., Tornos, F., Prieto-Ballesteros, O., Freeman, K.H., Pieper, D.H., Timmis, K.N., Amils, R., Parro, V. (2018) Viable cyanobacteria in the deep continental subsurface. PNAS (USA), doi: 10.1073/pnas.1808176115
- Escudero, C., Vera, M., Oggerin, M., Amils, R. (2018) Active microbial biofilms in deep continental subsurface poor porous rock samples from the Iberian Pyrite Belt. Scientific Reports, 8: 1538, doi: 10.1038/s41598-018-19903-z
- Rubin, S.S., Marín, I., Gómez, M.J., Morales, E., Zekker, I., San Martin, P., Rodríguez, N., Amils, R. (2017) Prokaryotic diversity and community composition in the Salar de Uyuni, a large scale, chaotropic salt flat. Environ. Microbiol., 19(9): 3745-3754, doi: 10.1111/1462-2920.13876.
- Amils, R. (2016) Lessons learned from thirty years of geomicrobiological studies of Río Tinto. Res. Microbiol., 167(7): 539-545, doi: 10.1016/j.resmic.2016.06.001
- Kaplan, H.H., Milliken, R.E., Fernández-Remolar, D., Amils, R., Robertson, K., Knoll, A.H. (2016) Orbital evidence for clay and acidic sulfate assemblages on Mars and mineralogical analogs from Río Tinto, Spain. J. Geol. Research, 275: 45-64, doi:10.1016/j.icarus.2016.03.019.
- Sánchez-Román, M., Puente-Sánchez, F., Parro, V., Amils, R. (2015) Nucleation of Fe-rich phosphates and carbonates on microbial cells and exopolymeric substances. Frontiers, doi: 10.3389/fmicb.2015.01024.
- Fernández-Remolar, D., Santamaría, J., Amils, R., Parro, V., Gómez-Ortiz, D., Izawa, M.R.M., Pérez-Rodríguez, R., Rodríguez, N., López-Martínez, N. (2015) Formation of iron-rich metazoan-like bivalve structure (IRBS) by microbial communities. Biogeoscience, 120(1): 147-168, doi: 10.1002/2014JG002745.
Tesis doctorales:
- Irene Sánchez-Andrea (2012). Diversidad microbiana de los sedimentos anaerobios del Río Tinto. Universidad Autónoma de Madrid, José Luis Sanz y Ricardo Amils.
Otras actividades:
- Editor de Encyclopedia of Astrobiology, Springer, 2011.
