Lunes, 18 de Diciembre de 2017

Dinámica y función del genoma

    Regulación de la expresión génica en Leishmania

 

 

 FotoGrupo 26Jul17

 


José María Requena Rolanía 

ECompogrupo

EListado

Resumen de Investigación:

 

La actividad del grupo está dirigida al estudio de aspectos moleculares del protista Leishmania, y de la inmunopatología que produce al infectar al huésped. Por un lado, hemos continuado estudiando procesos moleculares responsables de la peculiar manera en que este organismo regula la expresión génica, que ocurre en ausencia de regulación transcripcional. Por otro lado, hemos trabajado en el desarrollo de estrategias para el control de la leishmaniasis, una enfermedad que afecta a millones de personas.

 

Mediante técnicas de secuenciación masiva, estamos estableciendo los transcriptomas de varias especies de Leishmania (y mejorando las anotaciones genómicas) con la meta de identificar elementos reguladores, frecuentemente localizados en las regiones 3’ no traducidas de los mRNAs, y de proteínas de unión a RNA, claves en la regulación de la expresión génica. Este proyecto está siendo realizado en estrecha colaboración con la Dra Begoña Aguado (CBMSO). Para dar visibilidad a los resultados de nuestros estudios y facilitar la utilización de los datos generados, hemos diseñado la página Web Leish-ESP (https://leishseq.neocities.org/).

 

En la parcela sobre aspectos inmunopatológicos de la infección por Leishmania, dirigida por el Dr Manuel Soto, hemos avanzado en la caracterización de factores del parásito que interfieren con la respuesta inmunitaria del huésped. Asimismo, se han evaluado nuevas estrategias para el tratamiento y diagnóstico, y ensayado candidatos vacunales, en base al análisis de muestras procedentes de pacientes humanos y caninos, y al uso de infección experimental en modelos animales. Además, venimos participando en un Proyecto financiado por la comisión europea (FP7), titulado “Clinical Studies on a Multivalent Vaccine for Human Visceral Leishmaniasis” (MuLeVaClin) y que tiene como objetivo el desarrollo de una vacuna frente a la leishmaniasis visceral humana. Información adicional en el siguiente enlace: http://www.mulevaclin.eu. Finalmente, indicar que nuestro grupo pertenece a la red de enfermedades Tropicales del ISCIII: RICET (http://www.ricet.es).

 

 

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 La regulación de la expresión génica en Leishmania ocurre a nivel postranscripcional

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 


 

Publicaciones recientes:

    • Requena, J.M., Chicharro, C., Garcia, L., Parrado, R., Puerta, C.J. and Cañavate, C. (2012). Sequence analysis of the 3'-untranslated region of HSP70 (type I) genes in the genus Leishmania: its usefulness as a molecular marker for species identification. Parasites & Vectors 5: 87. PMID: 22541251
    • Rastrojo, A., Carrasco-Ramiro, F., Martín, D., Crespillo, A., Reguera, R.M., Aguado, B. and Requena, J.M. (2013). The transcriptome of Leishmania major in the axenic promastigote stage: transcript annotation and relative expression levels by RNA-seq. BMC Genomics 14(1):223. PMID: 23557257
    • Fraga, J., Montalvo, A.M., Van der Auwera, G., Maes, I., Dujardin, J.C., and Requena, J.M. (2013). Evolution and species discrimination according to the Leishmania heat-shock protein 20 gene. Infect Genet Evol 18: 229-237. PMID: 23722022
    • Ramirez, C.A., Requena, J.M., and Puerta, C.J. (2013). Alpha tubulin genes from Leishmania braziliensis: genomic organization, gene structure and insights on their expression. BMC Genomics 14, 454. PMID: 23829570
    • Ramirez, C.A., Dea-Ayuela, M.A., Gutierrez-Blazquez, M.D., Bolas-Fernandez, F., Requena, J.M., and Puerta, C.J. (2013). Identification of proteins interacting with HSP70 mRNAs in Leishmania braziliensis. J. Proteomics 94: 124-137. PMID: 24060997
    • Montalvo, A.M., Fraga, J., Rodriguez, O., Blanco, O., Llanos-Cuentas, A., Garcia, A.L., Valencia, B.M., Muskus, C., Van der Auwera, G., and Requena, J.M. (2014). Detección de Leishmania spp. en base al gen que codifica la proteína HSP20. Rev Peru Med Exp Salud Publica 31: 635-643. PMID: 25597712
    • Nocua, P.A., Ramirez, C.A., Barreto, G.E., Gonzalez, J., Requena, J.M., and Puerta, C.J. (2014). Leishmania braziliensis replication protein A subunit 1: molecular modelling, protein expression and analysis of its affinity for both DNA and RNA. Parasites & Vectors 7: 573. PMID: 25498946
    • Requena, J.M., Montalvo, A.M., and Fraga, J. (2015). Molecular Chaperones of Leishmania: Central Players in Many Stress-Related and -Unrelated Physiological Processes. Biomed Res Int 2015: 301326. PMID: 26167482
    • Alonso, G., Rastrojo, A., Lopez-Perez, S., Requena, J.M., and Aguado, B. (2016). Resequencing and assembly of seven complex loci to improve the Leishmania major (Friedlin strain) reference genome. Parasites & Vectors 9: 74. PMID: 26857920
    • Fernandez-Orgiler, A., Martinez-Jimenez, M.I., Alonso, A., Alcolea, P.J., Requena, J.M., Thomas, M.C., Blanco, L., and Larraga, V. (2016). A putative Leishmania DNA polymerase theta protects the parasite against oxidative damage. Nucleic Acids Res 44: 4855-4870. PMID: 27131366
    • Lombraña, R., Alvarez, A., Fernandez-Justel, J.M., Almeida, R., Poza-Carrion, C., Gomes, F., Calzada, A., Requena, J.M., and Gomez, M. (2016). Transcriptionally Driven DNA Replication Program of the Human Parasite Leishmania major. Cell Rep 16: 1774-1786. PMID: 27477279
    • Requena, J.M., Rastrojo, A., Garde, E., Lopez, M.C., Thomas, M.C., and Aguado, B. (2017). Genomic cartography and proposal of nomenclature for the repeated, interspersed elements of the Leishmania major SIDER2 family and identification of SIDER2-containing transcripts. Mol Biochem Parasitol 212, 9-15. PMID: 28034676
    • Requena, J.M., Rastrojo, A., Garde, E., Lopez, M.C., Thomas, M.C., and Aguado, B. (2017). Dataset for distribution of SIDER2 elements in the Leishmania major genome and transcriptome. Data Brief 11, 39-43. PMID: 28127581
    • Solana, J.C., Ramirez, L., Corvo, L., de Oliveira, C.I., Barral-Netto, M., Requena, J.M., Iborra, S., and Soto, M. (2017). Vaccination with a Leishmania infantum HSP70-II null mutant confers long-term protective immunity against Leishmania major infection in two mice models. PLoS neglected tropical diseases 11, e0005644. PMID: 28558043

 

Libros:

Stress Response in Microbiology. Caister Academic Press. Editor: Jose M. Requena. June 2012. ISBN: 978-1-908230-04-1. NLM ID: 101587947


 

Patentes:

Jose M. Requena Rolanía, J.M., Cristina Folgueira Fernández, C., Carrión Herrero, J. y Manuel Fresno Escudero, M. (2010) Use of strains of Leishmania ΔHSP70-II as a vaccine. Universidad Autónoma de Madrid. PCT/ES2010/070073.