bioweb: molecular modelling group / grupo de modelado molecular

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David García Aristegui

David García Aristegui.
(Madrid -Spain-. 1974)
Investigador Biomol-Informatics / CBMSO.

Centro de Biología Molecular "Severo Ochoa".
C/ Nicolás Cabrera, 1.
Campus UAM. Cantoblanco, 28049 Madrid. Spain.
Tel: (+34) 91-196-4662   Fax: (+34) 91-196-4420
e-mail: aristegui@cbm.uam.es
URL: http://www.cbm.uam.es/bioweb

Academic degrees / Títulos académicos
    1997. B.Sc. in Chemistry / Diplomado en Química (Universidad Computense de Madrid).
    1999. M. Sc. in Chemistry / Licenciado en Química (Universidad Computense de Madrid).
Career / Trayectoria profesional.
    2000-2001. Databases. Software developer. / Bases de datos. Desarrollo de aplicaciones. Arthur Andersen.
    2001-2003. I3P researcher / investigador I3P. Centro Nacional de Biotecnología. CSIC.
    2003-2004. Aula50 (training area of ISP Nodo50 / aula de formació del ISP Nodo50. Madrid.
    2004-2008. Specialized Tech. / Titulado Superior. Centro Nacional de Biotecnología. CSIC.
    2008. Researcher / Investigador. Biomol-Informatics - CBMSO.
    2008. Torres-Quevedo Contract - Ministry of Science and Innovation / Contrato Torres-Quevedo del Ministerio de Ciencia e Innovación.
    2009-. Cheminformatics & Drug Discovery. Molecular Modelling Group / Biomol-Informatics. Contract for Research and Development on Bioinformatics between Biomol-Informatics SL and Fundación "Severo Ochoa"
Technical skills /Conocimientos técnicos
  • Operating systems / Sistemas operativos: Windows, UNIX/Linux, MacOS X.
  • Programming languages / Lenguajes de programación: Visual Basic, Lotus Notes Script, C, Java, PHP, Perl, Shell scripting.
  • Databases / Bases de datos: Programación de BBDD con Lotus Notes. Administración y mantenimiento de BBDD MySQ.
  • Internet: Gestor de contenidos SPIP. HTML, Desarrollo de páginas web dinámicas LAMP (Linux + Apache + MySQL+ PHP), Servidor Web Apache.
  • Grid Computing/Computación distribuida: Administración de clústers linux para Grid Computing. Desarrollo de aplicaciones en entornos distribuidos y heterogéneos.
Courses /Cursos
  • Informatics / Informática:
    • Curso de Especialización de Desarrollo de Software, Grupo EIDOS.
    • Curso Administración de servidores Linux(Debian), Nodo50.
    • Curso Instalación y Administración de servidores Linux (SuSE), Ibertelecom Formación.
    • Curso Administración de Sistemas y Redes, Gabinete de Formación del CSIC.
    • Curso Clusters de Máquinas Linux, Gabinete de Formación del CSIC.
    • Curso Administración de MySQL bajo GNU/Linux, Nodo50.
    • Curso online Learn C Programming, UserActive Course Program de O'reilly.
    • Curso Diseño de webs dinámicos con SPIP, Nodo50.
    • Curso online Administering and Supporting Sun Grid Engine.

  • "Bioinformatics / Bioinformática:
    • Curso Introducción a los métodos de Threading y Modelado de Proteínas por Homología, curso de especialización para profesionales I3P del CSIC.
    • Curso de Introducción a la Dinámica Molecular, organizado por la Red Temática I3P de Bioinformática.

  • Grid Computing - EGEE:
    • Curso Biomed Application Developer's Course, CSIC.
    • Curso para desarrolladores Grid: LCG-2 Middleware Internals and APIs, CERN.
    • First EELA Grid tutorial for users and system administrators, CIEMAT.
Participation in R&D contracts / Participación en contratos de I+D.
  • 2008-2010. Contract for Research and Development on Bioinformatics between Biomol-Informatics SL and Fundación "Severo Ochoa". / Contrato de Investigación y Desarrollo en Bioinformática entre Biomol-Informatics SL y la Fundación "Severo Ochoa". (Coordinador: Paulino Gómez-Puertas).
  • 2010-2012. Contract for Research and Development on Bioinformatics between Biomol-Informatics SL and Fundación "Severo Ochoa". / Contrato de Investigación y Desarrollo en Bioinformática entre Biomol-Informatics SL y la Fundación "Severo Ochoa". (Coordinador: Paulino Gómez-Puertas).
  • 2009-2012. "DIVINOCELL. Exploiting Gram-negative cell division targets in the test tube to obtain antimicrobial compounds". FP7 collaborative project FP7-HEALTH-F3-2009-223431. (Biomol-Informatics).
  • 2011-2014. "DIGEN-1K: Experimental development of a Genetic Diagnostics Method using Next Generation Sequencing". Plan Nacional I+D+I Ref.: INNPACTO IPT-2011-0964-900000. (Principal Inv.: Paulino Gómez-Puertas).
Meetings / Congresos
  • "GROCK: high-throughput docking using lcg grid tools". SC|05: High Performance Computing, Networking, Storage and Analysis Conference & Exhibition conference, Seattle.
TEACHING / DOCENCIA

Collaboration in specialization courses / Colaboración en cursos de especialización: Other / Otros:
BIOWEB: MOLECULAR MODELLING GROUP
Centro de Biología Molecular "Severo Ochoa" (CSIC-UAM).
http://www.cbm.uam.es/bioweb 		C/ Nicolás Cabrera, 1. Campus UAM, Cantoblanco.
28049 Madrid. Spain
Tel: (+34) 91 196 4662 / 4663   Fax: (+34) 91 196 4420
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