bioweb: molecular modelling group / grupo de modelado molecular

http://www.cbm.uam.es/bioweb

 

Molecular Modelling Group / Grupo de Modelado Molecular.
Centro de Biología Molecular "Severo Ochoa" (CBMSO, CSIC-UAM).


People / Personal:

- Paulino Gómez-Puertas.
    Research Scientist at the Spanish National Research Council (CSIC) and Honorary Professor of the Autonomous University of Madrid (UAM). His research is focused on the integration of evolutive and structural information for the in silico simulation of macromolecular function.

    Científico Titular del Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC) y Profesor Honorario de la Universidad Autónoma de Madrid (UAM). Su investigación se centra en la integración de información evolutiva y estructural para la simulación in silico de la función de las macromoléculas.

- Eduardo López-Viñas.
    Postdoctoral Scientist Biomol-Informatics / CBMSO. Expert in homology modeling of protein structures, in silico 3D simulation of missense mutations and evolutive analysis of protein sequences and structures. He is also expert in docking of compounds to 3D models of active centers of proteins and in rationale drug design.

    Investigador Doctor Biomol-Informatics / CBMSO. Experto en modelado por homología de estructura de proteínas, simulación 3D in silico de mutaciones puntuales y en análisis evolutivo de secuencias y estructuras proteicas. Es experto en docking de compuestos a modelos 3D de centros activos de proteínas y en diseño racional de fármacos.

- Jesús Mendieta Gómez.
    Postdoctoral Scientist Biomol-Informatics / CBMSO. Expert in techniques of molecular dynamics and QM/MM applied to the study of protein structure, macromolecular interactions and in silico simulation of experimental enzyme modifications.

    Investigador Doctor Biomol-Informatics / CBMSO. Experto en técnicas de dinámica molecular y QM/MM aplicadas al estudio de estructura de proteínas, interacciones macromoleculares y simulación in silico de modificaciones experimentales de enzimas.

- Jan-Jaap Wesselink.
    Postdoctoral Scientist Biomol-Informatics / CBMSO. PhD in Bioinformatics and Executive Master's Degree in Business Administration. He is expert in genome analysis and in the use of computational tools for next-generation sequencing. He has large experience in the study of (conservation of) alternative splicing and alternative transcripts in genomes.

    Executive Master in Business Administration. Investigador Doctor Biomol-Informatics / CBMSO. Doctor en Bioinformática y Executive Master in Business Administration. Es experto en análisis de genomas y en el uso de herramientas computacionales para técnicas de secuenciación de nueva generación. Posse gran experiencia en el estudio de (y en el estudio de la conservación de) splicing alternativo y transcritos alternativos en genomas.

- David García Aristegui.
    Researcher Biomol-Informatics / CBMSO. Graduated in Chemistry. Expert in Chemi-informatics: programming, database administration and grid computing. He is also expert in high-throughput docking using grid computing environments.

    Investigador Biomol-Informatics / CBMSO. Licenciado en Químicas. Experto en Quimio-informática; programación, administración de bases de datos y computación en grid. Es experto en técnicas de docking de alto rendimiento utilizando entornos de computación en grid.

- Silvia Lusa Bernal.
    Researcher Biomol-Informatics / CBMSO. Graduated in Biology. Expert in Application development and Web application development. Servers and Databases. Design, implementation and administration of data network infrastructure.

    Investigadora Biomol-Informatics / CBMSO. Licenciada en Biología. Experta en Desarrolllo de aplicaciones y desarrollo web. Servidores y bases de datos. Diseño, implementación y administración de infraestructura para red de datos.

- Santiago de la Peña González.
    Researcher Biomol-Informatics / CBMSO. Graduated in Biology. Expert in Next Generation Sequencing (NGS) Data Analysis. Optimization of NGS bioinformatics procedures. Java (Eclipse), Text Mining (Apache UIMA), Databases (MySQL), Workflow (Talend), XML, Amazon Web Services (AWS), Perl, CVS.

    Investigador Biomol-Informatics / CBMSO. Licenciado en Biología Experto en Análisis de datos de Secuenciación Masiva (NGS). Optimización de procedimientos bioinformáaticos NGS. ava (Eclipse), Text Mining (Apache UIMA), Bases de datos (MySQL), Workflow (Talend), XML, Amazon Web Services (AWS), Perl, CVS.

- Fernando Martín García.
    PhD student at the CBMSO (CSIC-UAM). Graduate in Biotechnology. Molecular Dynamics of enzymatic mechanism of GTPases. Its application to the study of FtsZ and to the design of antimicrobials.

    Estudiante de doctorado en el CBMSO (CSIC-UAM). Licenciado en Biotecnología. Dinámica Molecular del mecanismo enzimático de GTPasas. Su aplicación al estudio de FtsZ y al diseño de antibióticos.

- Jesús-Ignacio Mendieta Moreno
    PhD student at the CBMSO (CSIC-UAM). Graduate in Physics. Quantum Mechanics / Molecular Mechanics (QM/MM) interface: implementation of Density Functional Theory (DFT) in the study of enzymatic mechanism of GTPases and ATPases.

    Estudiante de doctorado en el CBMSO (CSIC-UAM). Licenciado en Física. Interfaz Mecánica Cuántica / Mecánica Molecular: implementación de la Teoría de Funcionales de Densidad (DFT) en el estudio de los mecanismos enzimáticos de GTPasas y ATPasas.

- Íñigo Marcos Alcalde
    PhD student at the CBMSO (CSIC-UAM). Graduate in Biotechnology. Molecular Dynamics of the enzymatic mechanism of GTPases involved in chromosome segregation.

    Estudiante de doctorado en el CBMSO (CSIC-UAM). Licenciado en Biotecnología. Dinámica Molecular del mecanismo enzimático de GTPasas implicadas en segregación cromosómica.

Visitors / Visitantes:
    - Mónica Ramos (Universidad de Zaragoza). 2005.
      Evolutive and structural analysis of human 3-hydroxy-3-methylglutaryl Coenzyme A synthase.
      Análisis evolutivo y estructural de la enzima 3-hidroxi-3-metilglutaril Coenzima A sintasa humana.
    - Alejandro Llanes (Universidad de La Habana). 2006-2007.
      Phylogenetic reconstruction of the evolution of unichromosomal circular mitochondrial and (partial) bacterial genomes.
      Reconstrucción filogenética de la evolución de genomas circulares unicromosomales mitocondriales y bacterianos (parciales).

BIOWEB: MOLECULAR MODELLING GROUP
Centro de Biología Molecular "Severo Ochoa" (CSIC-UAM).
http://www.cbm.uam.es/bioweb
C/ Nicolás Cabrera, 1. Campus UAM, Cantoblanco.
28049 Madrid. Spain
Tel: (+34) 91 196 4662 / 4663   Fax: (+34) 91 196 4420
< home > < people > < research > < publications > < courses > < news > < spin-off > < links >