BIOWEB: MOLECULAR MODELLING GROUP

bioweb: molecular modelling group / grupo de modelado molecular

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RESEARCH LINES / LÍNEAS DE INVESTIGACIÓN.

	Development of a novel "in silico" drug design system based on the properties of the receptor molecule. This project is developed in the framework of an R&D contract between Biomol-Informatics (Madrid Science Park) and the Fundación "Severo Ochoa". Desarrollo de un nuevo sistema "in silico" de diseño de fármacos basado en las propiedades de la molécula receptora. Proyecto desarrollado en el marco de un contrato de I+D entre Biomol-Informatics (Parque Científico de Madrid) y la Fundación "Severo Ochoa".

	Bioinformatic modeling of Carnitine Palmitoyltransferase I enzyme and its relationship with obesity and insulin secretion: in silico design of anti-obesity drugs. Project in cooperation with the "Gene Regulation of Fatty Acids Group" at the Barcelona University. Modelos bioinformáticos de la enzima Carnitina Palmitoiltransferasa I y su relación con obesidad y secrección de insulina: diseño in silico de fármacos anti-obesidad. Proyecto en cooperación con el "Grupo de Regulación Génica de la Oxidación de Ácidos Grasos" de la Universidad de Barcelona.

	Molecular dynamics simulation of polymerization and depolymerization processes of bacterial septum protein FtsZ. in silico design of specific inhibitors to be used as antibacterial drugs. Project in cooperation with the "Genetic Control of the Cell Cycle" Lab. at the Centro Nacional de Biotecnología and Biomol-Informatics in the framework of a 7FP-EU Collaborative Project. Simulación mediante dinámica molecular de los procesos de polimerización y despolimerización de la proteína de septo bacteriano FtsZ: diseño in silico de inhibidores específicos que puedan utilizarse como futuros antibacterianos. Proyecto en cooperación con el Laboratorio de "Control Genético del Ciclo celular". del Centro Nacional de Biotecnología y Biomol-Informatics en el marco de un "Collaborative Project" del 7PM-UE.

Funding / Financiación.

	2008-2010. Contract for Research and Development on Bioinformatics between Biomol-Informatics SL and Fundación "Severo Ochoa". / Contrato de Investigación y Desarrollo en Bioinformática entre Biomol-Informatics SL y la Fundación "Severo Ochoa". (Coordinador: Paulino Gómez-Puertas).

	2008-2012. Type-C Consolider: "Molecular bases of action of carnitine palmitoyltransferases as regulators of fat oxidation and their role on insulin resistance, type II diabetes and the hypothalamic appetite regulation". / Eje-C Consolider: "Bases moleculares de acción de las carnitina aciltransferasas como reguladoras de la oxidación de las grasas y su papel en la obesidad, la resistencia a la insulina y el apetito". Plan Nacional I+D+I 2007. Ref: SAF2007-61926. (Coordinador Consolider: Fausto G. Hegardt, Univ. Barcelona).

	2007-2010. "COMBACT. New targets to combat pathogenic bacteria. / COMBACT. Nuevas dianas para combatir a las bacterias patógenas". Comunidad de Madrid, I+D Biociencias 2006. Ref: S-BIO-0260-2006. (Principal Inv: Paulino Gómez-Puertas).

	2007-2011. "Structure and function of human CPTI. / Estructura y función de la CPT1 humana.". F.I.S. CIBER 2006: Fisiopatología de la Obesidad y Nutrición. Ref: CB06/03/0026. (Principal Inv: Fausto G. Hegardt, Univ. Barcelona).

	2007-2009. "BIOSINCEL. Synthetic biology of cellular division: reconstruction of the bacterial division proto-ring. / BIOSINCEL. Biología sintética de la división celular: reconstrucción del proto-anillo de división bacteriano". CSIC: Proyectos Intramurales de Frontera 2006. Ref: 200620F0022. (Principal Inv: Paulino Gómez-Puertas).

	2004-2007. "Bioinformatics: Protein-protein and protein-ligand interactions. Modelling human CPTI function. / Bioinformática: Interacciones proteína-proteína y proteína-ligando. Modelado de la función de la CPTI humana". Plan Nacional I+D+I 2003. Ref: SAF2004-06843. (Principal Inv: Paulino Gómez-Puertas).

	2004. "Molecular basis of the anti-obesity properties of C75 compound. / Bases Moleculares de las Propiedades Anti-Obesidad del Fármaco C75". Fundación Puleva. Research Prize 2004. (Principal Inv: Fausto G. Hegardt, Univ. Barcelona).

	2003-2004. "GenomeSpace: sequence to structure. / GenomeSpace: de la secuencia a la estructura". Intramural CAB-CSIC. (Principal Inv: Paulino Gómez-Puertas).

	2002-2005. "Bio-PARTNeR: Protein interaction network / Bio-PARTNeR: Red de interacción entre proteínas". Fundación Ramón Areces. (Principal Inv: Paulino Gómez-Puertas).

BIOWEB: MOLECULAR MODELLING GROUP
Centro de Biología Molecular "Severo Ochoa" (CSIC-UAM).
http://www.cbm.uam.es/bioweb

C/ Nicolás Cabrera, 1. Campus UAM, Cantoblanco.
28049 Madrid. Spain
Tel: (+34) 91 196 4662 / 4663 Fax: (+34) 91 196 4420