Servicios científicos

Biocomputación e integración ómica

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Responsable del servicio

Daniel Carbajo Pedrosa

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Coordinador científico

Begoña Aguado Orea

Ugo Bastolla Bufalini

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Contacto

91 196 4634

sbio(at)cbm.csic.es

SBIO (Servicio de Biocomputación e integración ómica)

El SBIO, o Servicio de Biocomputación e Integración ómica, surge de la necesidad estratégica de centralizar el análisis de datos multiómicos y la modelización de estructuras macromoleculares en una única unidad dentro del CBM. Somos la unidad de referencia del centro dedicada exclusivamente a prestar apoyo en bioinformática, biología computacional y análisis de datos a nuestros grupos de investigación y a entidades externas.

Nuestro objetivo es diseñar soluciones analíticas adaptadas a las necesidades específicas de cada proyecto, facilitando la gestión y la interpretación de datos biológicos complejos.

Acompañamos a los investigadores a lo largo de todo el ciclo de vida de sus datos: desde el diseño experimental, el análisis de datos y la integración de fuentes, hasta la gestión y la custodia de los resultados. Ayudamos a contar la historia biológica que se esconde tras los datos de una manera clara, rigurosa y reproducible.

Áreas del servicio

Las capacidades técnicas y analíticas del SBIO se estructuran en las siguientes áreas principales:

  • Análisis e integración de datos ómicos: procesamiento, análisis estadístico y desarrollo de flujos de trabajo para la interpretación de conjuntos de datos masivos (NGS, proteómica, lipidómica, etc.), incluida la integración de diversas fuentes de datos multiómicos.
  • Análisis y modelización de sistemas y biomoléculas: caracterización mecánica y predictiva a nivel molecular. Integración del análisis de secuencias y la filogenia con la modelización estructural de proteínas y complejos, así como simulaciones de dinámica molecular y la evaluación de interacciones y mutaciones.
  • Análisis de datos de microscopía: apoyo informático para el procesamiento avanzado y la cuantificación de datos de imágenes, en coordinación directa con el Servicio de Microscopía Óptica Avanzada (SMOA).

Apoyo transversal e infraestructura

El SBIO también ofrece una serie de servicios generales de apoyo a la investigación:

  • Asesoramiento y diseño experimental: Asistencia técnica previa a la realización de un experimento (selección de la tecnología, tamaño de la muestra) y ayuda en la redacción de informes técnicos para solicitudes de subvenciones.
  • Gestión y administración de datos: Actuamos como intermediarios autorizados para el envío seguro de secuencias a los repositorios oficiales europeos (ENA, EGA), un requisito imprescindible para la publicación de resultados.
  • Infraestructura computacional: gestión y facilitación del acceso a recursos de computación científica de alto rendimiento (clústeres internos y acceso a nodos del CSIC, como NodoBio y DRAGO).
  • Formación: Organización de cursos y formación técnica a medida para dotar a los investigadores de autonomía en el uso de herramientas bioinformáticas y estadísticas.

Áreas del servicio

Personal

David Angel Abia Holgado

Lab.: 313.2 Ext.: 4634
dabia(at)cbm.csic.es

María Santos Galindo

Lab.: 313.2 Ext.: 4704
msantos(at)cbm.csic.es

Sandra González de la Fuente

Lab.: 313.2 Ext.: 4704
sandra.g(at)cbm.csic.es

Eva Sacristán Horcajada

Lab.: 312.2 Ext.: 4704
esacristan(at)cbm.csic.es

Paula Martínez García

Lab.: 313.2 Ext.: 4704
paula.martinez(at)cbm.csic.es

María Santos Romero

Lab.: 313.2 Ext.: 4704
msromero(at)cbm.csic.es

Daniel Carbajo Pedrosa

Lab.: 313.2 Ext.: 4634
daniel.carbajo(at)cbm.csic.es