Programa Científico

Homeostasis de tejidos y órganos

GRUPO DE INVESTIGACIÓN

Genómica funcional

Miguel Manzanares

Nuestro objetivo es comprender cómo se coordinan los diferentes aspectos de la función del genoma —concretamente, la replicación del ADN, la estructura tridimensional de la cromatina y la transcripción génica— y cómo se establecen durante las primeras etapas del desarrollo del ratón, partiendo de un genoma «virgen» y conduciendo a las primeras decisiones de linaje que tienen lugar en el embrión.

Investigación

El objetivo central de la investigación de nuestro grupo es comprender cómo se regula la actividad genómica durante las primeras etapas del desarrollo de los mamíferos y cómo las variaciones en la regulación y la estructura del genoma pueden contribuir a la aparición de enfermedades en el ser humano. Para ello, buscamos e identificamos secuencias reguladoras cis de acción distal, y estudiamos cómo actúan sobre sus genes diana y cómo se organizan estos en la estructura tridimensional de la cromatina y en las redes de regulación génica subyacentes a un estado biológico específico. Desde el punto de vista metodológico, utilizamos una combinación de herramientas bioinformáticas y de análisis de datos, genómica estructural, análisis a escala genómica, edición génica mediante el sistema CRISPR/Cas9 y ensayos funcionales con modelos animales transgénicos y células madre.

Estamos aplicando este enfoque al estudio de cuatro preguntas básicas:

¿Cómo se toman las decisiones de linaje, a partir del óvulo fertilizado, que dan como resultado la especificación de los tipos celulares iniciales del embrión?
¿Cuáles son los mecanismos reguladores que impulsan la transición de la pluripotencia a la determinación de linaje a lo largo del desarrollo?
¿Cuál es el papel de la estructura del genoma en la definición del estado celular y cómo se relaciona con la regulación de la expresión génica?
¿Cuál es la contribución de la variación regulatoria a las enfermedades humanas comunes?

Miembros del grupo

Alicia Gallego Jiménez

Lab.: 109 Ext.: 4469
agallego(at)cbm.csic.es

Miguel Manzanares Fourcade

Lab.: 407 Ext.: 4475
mmanzanares(at)cbm.csic.es

Elva Martín Batista

Lab.: 407 Ext.: 4474
embatista(at)cbm.csic.es

Aurora Arroyo Jiménez

Lab.: 407 Ext.: 4474
aurora.arroyo(at)cbm.csic.es

Andrea Maidana López

Lab.: 407 Ext.: 4474
amaidana(at)cbm.csic.es

Ana Isabel Gil Acero

Lab.: 407 Ext.: 4474
aigil(at)cbm.csic.es

Publicaciones representativas

Establishment of 3D chromatin structure after fertilization and the metabolic switch at the morula-to-blastocyst transition require CTCF

Andreu MJ et al.

Chromatin dynamics through mouse preimplantation development revealed by single molecule localisation microscopy

Portela M et al.

Pluripotency factors regulate the onset of Hox cluster activation in the early embryo

Tiana M et al.

Transitions in cell potency during early mouse development are driven by Notch

Menchero S et al.

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